Вы зашли по FTP на сайт и не можете удалить или отредактировать файлы и папки, загруженные через сайт?

Это потому что FTP доступы выделены на пользователя, который не владеет этими файлами и папками, а так как чужое — трогать не хорошо, он и не может ничего сделать.

Почему файлы принадлежать другому пользователю?

Зачастую, файлы загружаемые через веб-интерфейс сайта, по умолчанию принадлежать вашему веб-серверу, а именно apache. Так же, вы могли закачивать и создавать папки из под root пользователя в панеле управления сервером, такой как ISP.

Что сделать, чтобы можно было редактировать файлы другого пользователя?

Есть 3 варианта:

1. Делать это из под root

Root имеет наибольшие права, но работать из под него небезопасно.

2. Присвоить другого владельца

chown -R ИМЯ_ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ:ИМЯ_ГРУППЫ ПУТЬ/*

-R  значит рекурсивно, для файлов и папок

3. Занести два пользователя в одну группу

Это не является хорошей практикой безопасности. Просто заносим обоих пользователей в одну группу, с помощью команды:

usermod -a -G ИМЯ_ГРУППЫ ИМЯ_ПОЛЬЗОВАТЕЛЯ

Но это одноразовая помощь либо временная при проблеме, т.к. все загружаемые файлы с сайта будут иметь пользователя, из под которого и работает веб-сервер. Для устранения данной проблемы лучше настроить сервер таким образом, чтобы загружаемые файлы присваивались пользователю WWW-домена, а не веб-сервера.